ฮีเลียมเหลวจะมีอุณหภูมิเย็นจัดที่สุด (เย็นกว่าแก๊สเหลวชนิดอื่น) ดังนั้นต้องมีเครื่องมือและวิธีการใช้พิเศษกว่าอย่างอื่น เพราะอุณหภูมิที่เย็นจัดของฮีเลียมเหลวจะทำให้แก๊สทุกชนิดรวมทั้งอากาศกลั่นตัวเป็นน้ำแข็งเมื่อสัมผัสกับฮีเลียมเหลว ซึ่งจะไปอุดตันท่อระบายแก๊สฮีเลียม และเกิดน้ำแข็งปกคลุมท่อลำเลียงฮีเลียม ดังนั้น การใช้และการเก็บฮีเลียมจึงต้องกระทำในภาวะความดันอากาศสูงกว่าปกติ หรือภายในระบบปิดเพื่อป้องกัน การรวมตัวกับอากาศหรือแก๊สอื่นๆ